Klein Bonaire is een relatief klein en onbewoond eiland van 6 km² groot voor de kust van Bonaire. Het ligt recht voor de hoofdstad Kralendijk op een afstand van ongeveer 800 meter.
In 1996 werd bekend dat een plaatselijke projectontwikkelaar plannen had om op het eilandje een hotel, bungalows, winkels, een casino, duikshops en aanlegpieren te bouwen. De Stichting Bescherming Klein Bonaire kwam in actie en al snel werd duidelijk dat om het eilandje te redden het gekocht zou moeten worden van de projectontwikkelaar. Na langdurige onderhandelingen werd Klein Bonaire rond 2000 verkocht voor 4,2 miljoen euro. De Nederlandse regering en het Wereld Natuur Fonds en de stichting Bescherming Klein Bonaire droegen hun steentje bij. Nederland stelde wel als voorwaarde dat Klein Bonaire een officieel natuurpark zou moeten worden.
Klein Bonaire wordt nu beheert door STINAPA en het Bonaire Marine Park onderhoud het eiland en het boeien systeem rondom het eiland. Het is een uniek gebied met een fragiel ecosysteem. Bovendien is het een belangrijke broedplaats voor zeeschildpadden, met name de lederschildpad en de karetschildpad, en in de grotten op het eiland verblijven vleermuizen. Verder heeft Klein Bonaire één van de mooiste riffen in het Caribisch gebied met bijzondere en kleurrijke vissen. Het is slechts begroeid met kleine struiken, voornamelijk acasia's en verschillende soorten cactussen. STINAPA heeft in de afgelopen jaren veel lokale bomen gepland. Het is mogelijk om rondom het eiland te wandelen al is er geen wandelpad. Neem dus stevige schoenen mee en ga ervan uit dat het ongeveer drie uur wandelen is. Denk ook aan een hoed of pet en veel zonnebrand en water.

Klein Bonaire is een hele populaire duikbestemming . Dagelijks verzorgen de duikscholen op Bonaire duik- en  snorkeltours naar het eiland. Het rif rond Klein Bonaire begint vlak aan de kust en loopt door tot circa 35 m diepte. Het eiland staat bekend om de grote hoeveelheid  zeepaardjes en ander zeeleven.